'Run Boy Run' er den virkelige historie om Yoram Israel Fridman. I 1942 flygter han som 8-årig fra ghettoen i Warszawa. Han er våd, kold og alene i en stor polsk skov, hvor han finder sammen med en flok forældreløse jødiske børn, men de bliver fanget, og han er alene igen. Han tilbyder at arbejde for kost og logi, men bliver afvist og tævet, indtil han finder Magda. Hun kalder ham Jurek og lærer ham Ave Maria, så han kan passere for en polsk katolik. Men Magda bliver angivet til SS, og han er på flugt igen. Run Boy Run er en film om ukuelig livsvilje, om racisme og angst, men også om uselvisk altruisme.